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玉米YABBY基因家族的全基因组判定与剖析.pdf 6页

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江苏农业学报 (Jiangsu.,.ofA Sci.),2014,30(6):1267~1272 http://www.jSnYXb.con 葛 敏,吕远大年夜,张体付 ,等.玉米 YABBY基因家族的全基因组判定与剖析[J].江苏农业学报 ,20

  江苏农业学报 (Jiangsu.,.ofA Sci.),2014,30(6):1267~1272

  http://www.jSnYXb.con

  葛 敏,吕远大年夜,张体付 ,等.玉米 YABBY基因家族的全基因组判定与剖析[J].江苏农业学报 ,2014,30(6):1267—1272

  doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2014.06.013

  玉米 YABBY基因家族的全基 因组判定与剖析

  葛 敏, 吕远大年夜, 张体付, 李 坦, 张晓林,赵 涵

  (江苏省农业迷信院农业生物技巧研究所/江苏省农业生物学重点试验室,江苏 南京 210014)

  摘要: YABBY基因家族作为植物独有的转录因子家族,在调控植物侧生器官发育中发扬主要感化。本研究

  应用玉米全基因组数据剖析玉米 YABBY基因家族,说明该基因家族成员结构、系统退化发育关系和基因家族成

  员在玉米分歧组织及分歧发育时代的表达谱。结果显示 ,玉米参考基因组中存在 13个 YABBY基因,定名为ZmY-

  ABBY1一ZmYABBY13,依据系统发育关系和序列相似性将该基 因家族分为4亚类s1~S4。RNAseq数据显示玉米

  YABBY基因在籽粒、茎和茎端分生组织 (Shootapicalmeristem,SAM)、幼胚及叶片中有较高表达,预示玉米 YABBY

  基因能够在上述器官发育中发扬调控感化。本研究结果为进一步解析该基因家族的功用奠定了研究基础。

  关键词: 玉米;YABBY;转录因子;表达谱

  中图分类号: $634.3 文献标识码: A 文章编号: 1000-4440(2014)06—1267-06

  Genome—wideidentification andanalysisofYABBY genefamilyinmaize

  GEMin, Lt3Yuan—da, ZHANGTi.fu, LITan, ZHANGXiao—lin, ZHAOHan

  ( ££eofAgro-biotechnology/ProvincialKeyLabofAgro—biology,JiangsuAcademyofAgriculturalSciences,Nanjing210014,China)

  Abstract: YABBYgenefamily,asagroupofplant—specifictranscriptionfactors,isinvolvedinthedevelopmentof

  lateralorgansinplants.BasedonmaizeV3genomesequence,agenome-wideoverviewofgenefamilyinmaizewaspresen—

  ted,includingthegenestructures,phylogeny,andmRNA expressionatlasin18differentdevelopmentstages.Theanaly—

  seshaverevealed13 YABBYgenesexistinginmaizegenome,namedZmYABBY!-ZmYABBY13.Accordingtothephyloge—

  neticrelationshipsandsequencesimilarity,thegenefamilywasdividedinto4subgroups(S1一S4).YABBYgeneexpres—

  sionprofilinganalysisshowedthatsomegeneswerehighlyexpressedindevelopingseed,stem andshootapicalmeristem

  (SAM),embryoandleaf,suggestingYABBYgenesmayplayanpositiveroleinthedevelopmentofthesetissues.Thepre—

  liminary genomicsanalysislaysafoundationforfuturefunctionaldissectionofYABBYfamilygene.

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